57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3780 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  774    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  62.43 
 
 		 379 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.58 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.31 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.11 
 
 		 668 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.18 
 
 		 930 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.42 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.86 
 
 		 676 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.5 
 
 		 752 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.36 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.73 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.48 
 
 		 831 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.09 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.32 
 
 		 930 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.52 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.62 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.96 
 
 		 1293 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.74 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.56 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.76 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  26.3 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.97 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.91 
 
 		 627 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1146 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  26.71 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.94 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  32.18 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.52 
 
 		 903 aa  60.1  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.47 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  26.42 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  26.41 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  26.12 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.07 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.67 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  24.16 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  29.02 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.03 
 
 		 786 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1030 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  23.76 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1177 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1163 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  24.93 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  32.52 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 373 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.24 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.69 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  24.87 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.12 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  24.93 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 		 898 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.89 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>