More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3839 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  100 
 
 		 439 aa  872    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  65.6 
 
 		 437 aa  590  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 401 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.17 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.09 
 
 		 496 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.85 
 
 		 422 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.06 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.7 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  35.37 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  35.47 
 
 		 376 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.19 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.19 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  31.35 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  24.56 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  26.02 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  23.99 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  25.98 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  25.3 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  26.1 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  29.24 
 
 		 369 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  26.03 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 369 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  25.12 
 
 		 366 aa  106  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  23.85 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  23.85 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5992  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  24.06 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  28.01 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.84 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25.84 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  24.23 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3894  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 462 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2591  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 		 463 aa  96.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422822  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 372 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4262  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  25.13 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  25.19 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1968  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000223491  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25.47 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 538 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  26.4 
 
 		 352 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 455 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 372 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  25.24 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  26.03 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  23.71 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2808  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.635113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  23.4 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  23.79 
 
 		 351 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2286  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  25.37 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>