More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5992 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5992  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 405 aa  801    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4262  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.22 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3894  RND family efflux transporter MFP subunit  59.58 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.59 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 		 383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  32.96 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  31.81 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  33.72 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.81 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  31.81 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  31.81 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  31.81 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  31.81 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  31.55 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  31.55 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  32.77 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  31.3 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  35.15 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  37.73 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  32.19 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  29.9 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 451 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  30.79 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  35.85 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  30.87 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  30.81 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  32.73 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  32.08 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  30.33 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  31.81 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 455 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  32.47 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.87 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.31 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  36.63 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  34.64 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  31.31 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  32.77 
 
 		 396 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.3 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  34.23 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  34.23 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  34.23 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  34.23 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  34.23 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  34.51 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.55 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  30.41 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  31.18 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  31.36 
 
 		 413 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.47 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  31.36 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.72 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  34.15 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.56 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  31.36 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  31.09 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  37.46 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.21 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  32.76 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1531  secretion protein HlyD  34.09 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000126911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.59 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.31 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  32.1 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  33.99 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  37.23 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  35.12 
 
 		 383 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  31.93 
 
 		 441 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.93 
 
 		 441 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  33.92 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  33.92 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  32.35 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  29.87 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 436 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>