More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0483 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  88.51 
 
 		 91 aa  158  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  76.19 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  77.11 
 
 		 90 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  72.62 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  72.62 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  75.29 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  62.35 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  62.82 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  65.33 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  57.3 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  59.3 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  64 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  64 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 216 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 216 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 768 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  48.39 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.73 
 
 		 229 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 535 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.77 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  46.88 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  50 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  46.97 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.39 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  41.1 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  51.79 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0349  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  50.91 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  45.9 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>