More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1514 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  56.19 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 
320 aa  228  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  51.3 
 
 
319 aa  227  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  51.55 
 
 
325 aa  226  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  52.28 
 
 
324 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  50.26 
 
 
512 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  51.27 
 
 
248 aa  224  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  50.25 
 
 
322 aa  222  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  50.51 
 
 
255 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50.77 
 
 
510 aa  221  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
308 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  53.85 
 
 
270 aa  218  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  47.69 
 
 
313 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  45.18 
 
 
315 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
309 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  48.45 
 
 
314 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  51.27 
 
 
247 aa  214  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  47.21 
 
 
599 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  46.67 
 
 
308 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  47.18 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
312 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.15 
 
 
322 aa  210  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  48.24 
 
 
255 aa  210  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  45.69 
 
 
319 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  47.69 
 
 
322 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  47.94 
 
 
583 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  45.69 
 
 
319 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  49.74 
 
 
308 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  47.94 
 
 
323 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  45.69 
 
 
318 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  44.62 
 
 
346 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  44.62 
 
 
346 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  44.62 
 
 
346 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  44.16 
 
 
317 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  51.06 
 
 
333 aa  205  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  45.96 
 
 
307 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  47.94 
 
 
582 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  47.42 
 
 
582 aa  204  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.18 
 
 
318 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  49.74 
 
 
581 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  46.7 
 
 
594 aa  204  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.18 
 
 
318 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  48.45 
 
 
576 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  48.97 
 
 
580 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  47.42 
 
 
589 aa  204  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.18 
 
 
318 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  51.32 
 
 
311 aa  203  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 
580 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  48.45 
 
 
585 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  45.36 
 
 
593 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.94 
 
 
580 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 
257 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.09 
 
 
316 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  48.21 
 
 
311 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  45.36 
 
 
593 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 
350 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  45.36 
 
 
575 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 
327 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  45.18 
 
 
590 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  48.45 
 
 
576 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  47.42 
 
 
585 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  45.18 
 
 
590 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  46.39 
 
 
580 aa  200  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  47.96 
 
 
311 aa  201  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.91 
 
 
580 aa  200  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.91 
 
 
580 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  49.48 
 
 
275 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  46.94 
 
 
322 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  45.36 
 
 
583 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  45.96 
 
 
317 aa  198  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  45.13 
 
 
307 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  46.56 
 
 
322 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.91 
 
 
578 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  47.94 
 
 
579 aa  197  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
578 aa  197  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  46.91 
 
 
578 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  46.91 
 
 
578 aa  197  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  46.91 
 
 
578 aa  197  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
578 aa  197  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
578 aa  197  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
578 aa  197  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  44.16 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
578 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
322 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  44.67 
 
 
313 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  43.65 
 
 
314 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
315 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.33 
 
 
335 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  44.67 
 
 
317 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  45.36 
 
 
578 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
578 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  46.97 
 
 
599 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  44.16 
 
 
311 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
578 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
578 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 
578 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  45.69 
 
 
328 aa  194  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
551 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
578 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>