238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1908 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  100 
 
 		 391 aa  779    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.97 
 
 		 503 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.33 
 
 		 392 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.38 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  30.33 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.75 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.18 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  30.28 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.61 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.99 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  30.81 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  29.13 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  30.21 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  27.89 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  27.11 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.73 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  30.21 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.18 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.84 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.02 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.31 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.97 
 
 		 396 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  28.15 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  22.83 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.37 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.52 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  28.32 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  27.78 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  19.4 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.3 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.9 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.25 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  25.3 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  23.67 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  22.61 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  23.86 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  21.72 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  26.67 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  25.74 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.56 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  24.52 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  21.75 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.94 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.09 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  26.54 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  27.11 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  24.05 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  24.05 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  24.05 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  25.99 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  27.34 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  31.02 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.02 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  23.42 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  22.9 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  24.44 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  22.64 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.78 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  21.72 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  23.61 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  20.69 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  26.99 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  25.78 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.78 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  24.73 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  22.73 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  22.73 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  24.93 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  24.94 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  22.34 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  22.73 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  22.34 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  22.34 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  22.73 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  22.34 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  22.34 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  22.73 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  23.89 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  22.01 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.74 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  23.33 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.59 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  24.1 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  19.1 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  21.55 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  23.85 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  27.27 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  23.59 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  25.53 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  23.68 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  21.66 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>