98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1163 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 323 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  74.32 
 
 		 319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  47.91 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  43.89 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  40.66 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  39.45 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  36.95 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  37.58 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  34.92 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  37.79 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  35.22 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  35.12 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  34.01 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  33.67 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  33 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  36.12 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  33.22 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  30.98 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  34.45 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  34.56 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  32.44 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  33.78 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  28.43 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  29.49 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  28.43 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  28.43 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  28.43 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  32.09 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  32.27 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  27.76 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  30.23 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  30.23 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  30.23 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  30.96 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  27.76 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.4 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  30.83 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.15 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  24.56 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  26.35 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  29.57 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  25.17 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.71 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  25.37 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  32.28 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  25.67 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  25.82 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.41 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  31.01 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  26.75 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  24.02 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  24.51 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.64 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  25.39 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  29.75 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  28.85 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 362 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  27.62 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  24.12 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  26.98 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  22.73 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  28.18 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  24.49 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.94 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  27.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  29 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  24.68 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  21.15 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  23.33 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  21.93 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  24.59 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  24.34 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  24.02 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  26.41 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  25.94 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>