164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1118 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  85.29 
 
 		 285 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  52.4 
 
 		 622 aa  288  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.2 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  37.59 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  39.01 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  35.78 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.32 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 265 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  32.55 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  31.82 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 199 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.8 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  32.99 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  26.84 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  26.67 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  27.08 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  29.21 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  29.76 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.33 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.89 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  28.64 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  26.67 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  28.99 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.99 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  28 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  25.37 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.11 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.69 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  28.22 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  28.22 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.08 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  27.48 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  26.46 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  23.98 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  27.59 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  27.72 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  27.72 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  24.27 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  27.72 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  25.97 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.94 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  26.19 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  26.72 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  24.63 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.44 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  26.79 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.44 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.87 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.38 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  24.87 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.82 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.35 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.52 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  23.81 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  24.38 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  30.47 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.78 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  23.63 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  21.6 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>