More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1548 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  56.85 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  52.26 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  52.28 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  51.52 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3640  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.55 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883875  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  50 
 
 		 195 aa  191  7e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  59.26 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  54.32 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  56.17 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  52.47 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  47.64 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  51.85 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  53.09 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  54.32 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  53.05 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  50.62 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 203 aa  171  9e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  55.15 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  52.12 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  51.85 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  54.32 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  52.76 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  50.31 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  51.22 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  50.62 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  50.62 
 
 		 208 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  50.31 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  49.38 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  49.38 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  42.58 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  49.69 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.52 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  51.53 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  48.47 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  47.53 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  49.08 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  45.16 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  46.01 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  48.47 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  49.69 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  48.47 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>