More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4052 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4052  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
343 aa  641    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4085  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.54 
 
 
342 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3942  cell wall surface anchor family protein  94.46 
 
 
343 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1691  RND family efflux transporter MFP subunit  68.69 
 
 
335 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3874  secretion protein HlyD  58.77 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 
345 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.16 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  35.58 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  35.58 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.92 
 
 
373 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 
352 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 
370 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 
352 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  28.86 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  28.24 
 
 
365 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  23.71 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 
390 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 
360 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.21 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  30.74 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  30.58 
 
 
377 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  30.24 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 
390 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  26.32 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  30.13 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1435  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.43 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0641  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0664  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25.9 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  27.64 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.03 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.79 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  28.92 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  27.21 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  31.65 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  29.28 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3102  AcrA/AcrE family protein  26.64 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.81 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3571  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239658  normal  0.276589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  26.7 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.18 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.21 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  31.55 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.32 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  22.15 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.02 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  28.17 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 
368 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.78 
 
 
380 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0697  RND family efflux transporter MFP subunit  36.3 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>