140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4029 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  44.7 
 
 
799 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  51.96 
 
 
826 aa  741    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  60.56 
 
 
808 aa  890    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  43.21 
 
 
787 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  44.05 
 
 
796 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  44.76 
 
 
796 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  100 
 
 
813 aa  1565    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  44.03 
 
 
794 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  52.42 
 
 
831 aa  824    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  94.94 
 
 
809 aa  1388    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  51.47 
 
 
808 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  56.51 
 
 
834 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  45.34 
 
 
793 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  45.34 
 
 
799 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  55.36 
 
 
821 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  45.08 
 
 
799 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  50.51 
 
 
813 aa  703    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  44.02 
 
 
784 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  55.24 
 
 
821 aa  857    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  44.66 
 
 
799 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  96.55 
 
 
813 aa  1452    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  47.63 
 
 
799 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  45.47 
 
 
790 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  53.75 
 
 
827 aa  820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  43 
 
 
795 aa  632  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  41.21 
 
 
772 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  40.93 
 
 
767 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  40.57 
 
 
770 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  40.37 
 
 
767 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  39.95 
 
 
771 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  39.95 
 
 
771 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  39.95 
 
 
771 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  39.56 
 
 
771 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  40.71 
 
 
768 aa  562  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  40.08 
 
 
771 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  40.08 
 
 
771 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  40.08 
 
 
771 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  39.25 
 
 
768 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  39.95 
 
 
771 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  39.84 
 
 
769 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  39.64 
 
 
771 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  39.32 
 
 
772 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  39.59 
 
 
771 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  39.07 
 
 
784 aa  519  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  39.57 
 
 
820 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  37.42 
 
 
786 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  37.42 
 
 
786 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  37.19 
 
 
786 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  37.47 
 
 
786 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  37.38 
 
 
816 aa  486  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  39.6 
 
 
810 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  37 
 
 
786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  37.04 
 
 
786 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  37.04 
 
 
786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  37.04 
 
 
786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  37.9 
 
 
783 aa  472  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  37.84 
 
 
797 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  36.67 
 
 
787 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  38.4 
 
 
804 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  37.19 
 
 
799 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  38.05 
 
 
794 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  38.34 
 
 
804 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  36.67 
 
 
786 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  27.81 
 
 
797 aa  235  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  27.27 
 
 
791 aa  233  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  26.56 
 
 
808 aa  230  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  27.67 
 
 
790 aa  227  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.02 
 
 
796 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.94 
 
 
792 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  26.53 
 
 
799 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  25.42 
 
 
806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  25.29 
 
 
805 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.1 
 
 
830 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  25.89 
 
 
805 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  25.89 
 
 
805 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.8 
 
 
727 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.06 
 
 
778 aa  92  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  18.35 
 
 
804 aa  91.3  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.25 
 
 
1051 aa  90.5  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.89 
 
 
806 aa  87.8  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.81 
 
 
807 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.53 
 
 
764 aa  85.1  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.39 
 
 
869 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.3 
 
 
831 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.39 
 
 
869 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.93 
 
 
773 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.22 
 
 
788 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.94 
 
 
755 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.66 
 
 
1291 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.72 
 
 
811 aa  68.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.04 
 
 
898 aa  68.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.58 
 
 
803 aa  67.8  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  17.33 
 
 
808 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.46 
 
 
800 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.52 
 
 
905 aa  60.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.77 
 
 
385 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 
385 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.7 
 
 
837 aa  60.1  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.23 
 
 
385 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  20.38 
 
 
807 aa  58.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>