More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1175 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1175  inner-membrane translocator  100 
 
 
328 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  44.06 
 
 
340 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 
333 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
339 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
342 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  39.03 
 
 
652 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  39.61 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
346 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
328 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
340 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
328 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  40.2 
 
 
318 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  40 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  38.31 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
358 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  40.25 
 
 
320 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
315 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  40.26 
 
 
314 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.74 
 
 
314 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
339 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
339 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.41 
 
 
852 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  38.85 
 
 
621 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  38.67 
 
 
344 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
332 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
333 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 
331 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  38.46 
 
 
632 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
315 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  38.19 
 
 
328 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
309 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  39.86 
 
 
317 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  38.93 
 
 
330 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
334 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  42.28 
 
 
313 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  38.92 
 
 
594 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
329 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
344 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  38.71 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  37.59 
 
 
838 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
331 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  38.94 
 
 
339 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  37.25 
 
 
323 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  38.8 
 
 
334 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
332 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.26 
 
 
332 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  40.19 
 
 
344 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  39.25 
 
 
840 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
343 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
339 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  39.12 
 
 
332 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  32.29 
 
 
402 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  39.51 
 
 
329 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.6 
 
 
323 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
342 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  38.19 
 
 
333 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
346 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  38.08 
 
 
328 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
344 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  35.92 
 
 
335 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  34.33 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  35.79 
 
 
323 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
646 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.54 
 
 
646 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
351 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
313 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
330 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
334 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  35.25 
 
 
842 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  40.2 
 
 
332 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.97 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  36.72 
 
 
318 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
335 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
399 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  38.63 
 
 
338 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
323 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
324 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  39.75 
 
 
337 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
329 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  35.76 
 
 
628 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  37.54 
 
 
597 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3966  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
337 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  39.23 
 
 
343 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
349 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  42.25 
 
 
341 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
633 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
632 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.11 
 
 
656 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  39.33 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  35.06 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
324 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
329 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  40.54 
 
 
311 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>