More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0680 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0680  fimbrial protein pilin  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0607972  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0669  fimbrial protein pilin  51.71 
 
 
195 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0635  fimbrial protein pilin  57.31 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0669  fimbrial protein pilin  57.32 
 
 
190 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  45.54 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  44.05 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  59.02 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  72.09 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  64 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  71.43 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.31 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  70.73 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  70.45 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  45.68 
 
 
160 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  50.88 
 
 
187 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  67.44 
 
 
141 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  32.24 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  68.29 
 
 
133 aa  61.6  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  70 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  70.73 
 
 
111 aa  61.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  45.16 
 
 
137 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  68.18 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  31.37 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  48.08 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  55.74 
 
 
133 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  70.73 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  70 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  40.43 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  69.77 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 
133 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  61.9 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  65.85 
 
 
170 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  51.56 
 
 
168 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  40 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  61.9 
 
 
173 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  40 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  67.44 
 
 
163 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  67.5 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  47.62 
 
 
134 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  55.77 
 
 
139 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  65.85 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  33.12 
 
 
173 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  60.47 
 
 
148 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  70 
 
 
179 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  63.41 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  65.91 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.23 
 
 
142 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  45.45 
 
 
140 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  38.2 
 
 
135 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.91 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.17 
 
 
148 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 
447 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  57.78 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  46.15 
 
 
70 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  69.23 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  64.29 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
135 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  67.44 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
151 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 
447 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  67.5 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.94 
 
 
168 aa  55.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 
447 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  63.16 
 
 
152 aa  55.1  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  48.33 
 
 
143 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  59.52 
 
 
157 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  70.59 
 
 
142 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  36.47 
 
 
165 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  60 
 
 
167 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  70.59 
 
 
138 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  58.54 
 
 
137 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  62.79 
 
 
166 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  70.59 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  57.14 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.27 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  41.1 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  56.25 
 
 
142 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.1 
 
 
145 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  55.32 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  65.79 
 
 
137 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  66.67 
 
 
162 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.98 
 
 
163 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  63.41 
 
 
148 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  45 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  53.66 
 
 
446 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  39.51 
 
 
135 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  37.89 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 
162 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  43.1 
 
 
134 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  29.05 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  53.66 
 
 
438 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  52.08 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  50 
 
 
149 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  43.33 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  44.26 
 
 
129 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>