More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1413 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
735 aa  1502    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.29 
 
 
724 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.84 
 
 
753 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.39 
 
 
734 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.72 
 
 
750 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.14 
 
 
464 aa  173  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.59 
 
 
496 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.93 
 
 
745 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  33.09 
 
 
790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.46 
 
 
721 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  33.02 
 
 
667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.45 
 
 
575 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  35.32 
 
 
484 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  33.67 
 
 
503 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 
711 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.73 
 
 
779 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.77 
 
 
736 aa  154  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
738 aa  153  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.98 
 
 
804 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  35.64 
 
 
624 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.73 
 
 
240 aa  152  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.42 
 
 
225 aa  151  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.25 
 
 
743 aa  151  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  36.22 
 
 
232 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.56 
 
 
492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  33.57 
 
 
806 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.55 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.69 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  39.41 
 
 
225 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.04 
 
 
733 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.47 
 
 
720 aa  147  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  38.12 
 
 
225 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  38.42 
 
 
225 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.62 
 
 
454 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.29 
 
 
463 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  37.93 
 
 
225 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  37.2 
 
 
246 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  37.44 
 
 
257 aa  146  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  36.28 
 
 
233 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.38 
 
 
727 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  36.59 
 
 
233 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  35.81 
 
 
233 aa  145  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  32.78 
 
 
741 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  36.28 
 
 
233 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.12 
 
 
755 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 
790 aa  144  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.38 
 
 
741 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  34.87 
 
 
786 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  35.81 
 
 
233 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.71 
 
 
756 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.81 
 
 
234 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.24 
 
 
741 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.24 
 
 
741 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  36.28 
 
 
233 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.24 
 
 
741 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.5 
 
 
235 aa  142  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.9 
 
 
615 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.87 
 
 
772 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.8 
 
 
508 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  31.43 
 
 
466 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.79 
 
 
722 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  35.35 
 
 
224 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.55 
 
 
763 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  28.15 
 
 
726 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  33.11 
 
 
529 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  35.95 
 
 
477 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24.9 
 
 
727 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.44 
 
 
737 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.24 
 
 
741 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 
741 aa  138  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.6 
 
 
505 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
737 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  35.55 
 
 
249 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  36.2 
 
 
474 aa  137  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  31.33 
 
 
749 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  29.64 
 
 
747 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  29.82 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.24 
 
 
741 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 
774 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  33.44 
 
 
509 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.9 
 
 
741 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.18 
 
 
756 aa  136  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  31.74 
 
 
521 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  30.73 
 
 
797 aa  134  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  31.46 
 
 
745 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  29.76 
 
 
775 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  36.8 
 
 
605 aa  133  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  31.34 
 
 
802 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  28.43 
 
 
739 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
524 aa  133  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  24.39 
 
 
743 aa  133  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 
228 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  29.02 
 
 
734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 
228 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  31.07 
 
 
766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  32.22 
 
 
472 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
731 aa  131  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26 
 
 
756 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.95 
 
 
734 aa  131  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>