More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3292 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.81 
 
 		 2108 aa  715    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  51.97 
 
 		 7210 aa  1774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.92 
 
 		 2232 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  51.61 
 
 		 1789 aa  1426    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.73 
 
 		 3033 aa  930    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.53 
 
 		 4575 aa  1959    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.51 
 
 		 2374 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  36.24 
 
 		 2604 aa  898    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  48.36 
 
 		 2367 aa  1130    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.95 
 
 		 2719 aa  1332    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.71 
 
 		 2066 aa  1035    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 		 3176 aa  1562    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  52.68 
 
 		 2376 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  46.13 
 
 		 4111 aa  1117    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.57 
 
 		 4840 aa  1372    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  51.84 
 
 		 1831 aa  1415    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  51.24 
 
 		 5255 aa  1694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.67 
 
 		 3449 aa  1372    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 1874 aa  797    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.71 
 
 		 2846 aa  1268    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.55 
 
 		 4607 aa  1362    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.11 
 
 		 2136 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.91 
 
 		 3254 aa  991    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 		 2880 aa  690    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  60.51 
 
 		 3408 aa  1704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  50.21 
 
 		 3158 aa  1239    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 3874 aa  7413    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  54.92 
 
 		 1071 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 		 2230 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  53.85 
 
 		 1548 aa  903    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  51.35 
 
 		 2090 aa  951    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 		 3645 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  47.12 
 
 		 4151 aa  2505    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  51.42 
 
 		 2081 aa  829    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.73 
 
 		 1559 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  50.43 
 
 		 4080 aa  1383    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.02 
 
 		 3493 aa  1371    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  50.1 
 
 		 2024 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.85 
 
 		 2333 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  43.41 
 
 		 2020 aa  1306    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 3693 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  36.36 
 
 		 5526 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.15 
 
 		 3092 aa  994    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.12 
 
 		 2107 aa  1043    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.21 
 
 		 2085 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  52.29 
 
 		 1114 aa  848    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45.47 
 
 		 1402 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  53.19 
 
 		 1955 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.12 
 
 		 2551 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.29 
 
 		 7110 aa  1777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 1354 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  51.02 
 
 		 5154 aa  1425    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  46.37 
 
 		 4882 aa  1462    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  33.87 
 
 		 2101 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.05 
 
 		 2890 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  54.91 
 
 		 3148 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.9 
 
 		 2060 aa  1469    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.25 
 
 		 4478 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  46.89 
 
 		 3670 aa  1294    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  33.29 
 
 		 2188 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 3693 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.73 
 
 		 2847 aa  1142    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  52.8 
 
 		 3355 aa  1343    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  56.07 
 
 		 6768 aa  3100    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 2085 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  47.04 
 
 		 4930 aa  1414    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  52.74 
 
 		 3494 aa  1746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.48 
 
 		 3676 aa  1029    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.41 
 
 		 2113 aa  1136    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 		 3696 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.7 
 
 		 2126 aa  1472    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.9 
 
 		 1805 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 		 1837 aa  990    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.94 
 
 		 1559 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  34.16 
 
 		 1828 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.07 
 
 		 3508 aa  1471    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.77 
 
 		 1924 aa  1211    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.07 
 
 		 1349 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.68 
 
 		 3711 aa  1566    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  56.47 
 
 		 1584 aa  894    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  38.6 
 
 		 3045 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  48.39 
 
 		 1820 aa  1269    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  46.72 
 
 		 1616 aa  1119    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 		 1832 aa  794    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.61 
 
 		 1867 aa  1298    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 		 3702 aa  824    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  57.22 
 
 		 1601 aa  918    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 5400 aa  1526    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.42 
 
 		 2085 aa  768    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.24 
 
 		 1349 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.66 
 
 		 7279 aa  1672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  56.3 
 
 		 1593 aa  832    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  54.57 
 
 		 1143 aa  844    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 		 1816 aa  1310    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.41 
 
 		 3679 aa  1013    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  49.86 
 
 		 3463 aa  1528    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.67 
 
 		 1939 aa  808    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.48 
 
 		 1602 aa  1295    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.05 
 
 		 4183 aa  865    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.67 
 
 		 2966 aa  1305    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>