More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2764 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 683 aa  1355    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  55.36 
 
 		 695 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 		 707 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  41.27 
 
 		 668 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  41.09 
 
 		 672 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  36.92 
 
 		 612 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  38.57 
 
 		 567 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 628 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 622 aa  144  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.32 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 		 343 aa  101  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.68 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 361 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1421 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 284 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 617 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 		 1056 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 		 1022 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 615 aa  90.5  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 1056 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.66 
 
 		 1979 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 649 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 406 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 406 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1138 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 		 818 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  23.64 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1676 aa  84.7  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 4079 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.45 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 878 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 573 aa  84  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 988 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  24.41 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1192 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.34 
 
 		 810 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.53 
 
 		 706 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 955 aa  82.4  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.88 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.17 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  23.85 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.38 
 
 		 1056 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 762 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 662 aa  78.2  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.64 
 
 		 875 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 732 aa  78.6  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 3035 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.81 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  24.62 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.31 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.74 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.37 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.83 
 
 		 417 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 391 aa  77  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1509  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 502 aa  76.6  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 620 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.06 
 
 		 1694 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 687 aa  75.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 		 2240 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1276 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  26.62 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 178 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 3560 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.91 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.89 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1276 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 4489 aa  74.3  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 601 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 808 aa  73.9  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.06 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 909 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 927 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.02 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.02 
 
 		 626 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 935 aa  73.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.53 
 
 		 745 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 3145 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>