More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3112 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  96.85 
 
 		 225 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  77.17 
 
 		 235 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  76.06 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  75.78 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  76.89 
 
 		 214 aa  299  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  75.83 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  72.56 
 
 		 217 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  68.52 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  64.52 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  59.43 
 
 		 245 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  59.17 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  58.45 
 
 		 238 aa  227  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  52.05 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  57.92 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  50.45 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.51 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  45.58 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.37 
 
 		 231 aa  181  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  46.92 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.13 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  46.85 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  44.89 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.13 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  53.54 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 318 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  49.51 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 242 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  48.7 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  47.12 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.25 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  49.3 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  49.51 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  43.12 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  45.19 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.45 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  43.46 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  52.36 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  46.95 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.47 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  47.85 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  47.66 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.98 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  49.54 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  46.33 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  45.54 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.34 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.11 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  48.83 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 643 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  44.5 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  47.25 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  45.16 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.57 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.06 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  44.71 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.44 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.99 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.14 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.87 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  48.67 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  44.34 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  43.06 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  48.67 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  48 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  49.22 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>