95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3324 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  82.99 
 
 		 215 aa  342  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  82.99 
 
 		 215 aa  342  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  80.75 
 
 		 209 aa  320  7e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  54.4 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  59.04 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  45.74 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  44.02 
 
 		 203 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  44.02 
 
 		 203 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  44.57 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  39.89 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  57.66 
 
 		 148 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  41.44 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  38.24 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  37.75 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  39.7 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  37.25 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  83.78 
 
 		 74 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  37.76 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  37.76 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 		 74 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  39.8 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  39.3 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  39.8 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  32.45 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  39.8 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  38.97 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  38.97 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  38.27 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  34.54 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  37.37 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.04 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.04 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  34.54 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  37.76 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  37.44 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  36.92 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.54 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.83 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  35.45 
 
 		 222 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  39.73 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  36.73 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  33.86 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  33.33 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  33.86 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  40.3 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  36.67 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  36.22 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.12 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  35.75 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  36.16 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  38.1 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  35.17 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  38.06 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  36 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  36.8 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  30.68 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  37.8 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  33.33 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  28.79 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  36.49 
 
 		 128 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  38.1 
 
 		 63 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  26.49 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.62 
 
 		 544 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  28.91 
 
 		 475 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  40.3 
 
 		 126 aa  44.7  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  41.38 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  45.1 
 
 		 75 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 474 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  34.38 
 
 		 476 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.34 
 
 		 484 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.34 
 
 		 484 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  27.7 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.08 
 
 		 343 aa  41.6  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  40 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  54.29 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>