125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2163 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  32.24 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  30.71 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  30.28 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  31.2 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.93 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  30.43 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  32.6 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  29.52 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  32.51 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  28.93 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  30.99 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  28.27 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  31.33 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  32.35 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  32.09 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  31.78 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  31.91 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  32.6 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  30.64 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  31.49 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.36 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  29.77 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  30.6 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  30.77 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  29.6 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  31.39 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  27.97 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.86 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  30.33 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  30.34 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  28.7 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  24.77 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  29.56 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  24.32 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  29.27 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  26.64 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  29.73 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  30.09 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  26.58 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  30.09 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  29.78 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25.45 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  29.74 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  23.02 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  25.11 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  25.42 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  23.46 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  29.17 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  30.04 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.16 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  28.27 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  24.69 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  29.26 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  27.19 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  24.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  27.45 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  27.85 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.16 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30.3 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.55 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  24.32 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  26.05 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.55 
 
 		 347 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  29.67 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  20.88 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  30.3 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.76 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  28.7 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  29.27 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.79 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.03 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  26.94 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  24.18 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  26.45 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.03 
 
 		 347 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.46 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  28.22 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  23.44 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  24.24 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.93 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  26.48 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  27.12 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  23.72 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  24.66 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  29.96 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  28.09 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  27.72 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  25.94 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  24.27 
 
 		 288 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  25.35 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  26.2 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.34 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  21.85 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  27.57 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>