More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02278 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  100 
 
 
1407 aa  2919    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  54.74 
 
 
1259 aa  1073    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  44.4 
 
 
1558 aa  1032    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  41.04 
 
 
995 aa  694    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  50 
 
 
1566 aa  1121    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  42.72 
 
 
956 aa  494  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  46.51 
 
 
1222 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  43.14 
 
 
1431 aa  475  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  43.42 
 
 
970 aa  461  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  45.96 
 
 
1096 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  42.91 
 
 
1414 aa  450  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  45.45 
 
 
1111 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  37.85 
 
 
1156 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  43.14 
 
 
1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.88 
 
 
589 aa  440  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  41.84 
 
 
1519 aa  426  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  40.46 
 
 
1517 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  44.52 
 
 
860 aa  396  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  41.68 
 
 
522 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  43.19 
 
 
509 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  40.53 
 
 
663 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  40.37 
 
 
495 aa  358  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  38.68 
 
 
1443 aa  347  8e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  38.38 
 
 
479 aa  337  7.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  35.11 
 
 
1326 aa  308  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  35.26 
 
 
1107 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
1112 aa  304  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  35.21 
 
 
1904 aa  295  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.36 
 
 
1087 aa  295  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  33.1 
 
 
1901 aa  294  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.2 
 
 
1193 aa  292  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.07 
 
 
939 aa  290  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.7 
 
 
1139 aa  290  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  35.19 
 
 
1067 aa  289  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  35.29 
 
 
1848 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  33.16 
 
 
1093 aa  280  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
1082 aa  278  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32.43 
 
 
1769 aa  275  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.98 
 
 
1125 aa  275  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  34.3 
 
 
711 aa  274  8.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
1069 aa  273  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.85 
 
 
1068 aa  273  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  45.3 
 
 
926 aa  269  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  43.22 
 
 
1698 aa  267  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.34 
 
 
1062 aa  266  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  35.69 
 
 
1077 aa  266  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  35.25 
 
 
1134 aa  265  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
1069 aa  265  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  41.5 
 
 
1053 aa  264  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.95 
 
 
1181 aa  263  2e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
1091 aa  262  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  42.64 
 
 
1557 aa  262  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  43.6 
 
 
1246 aa  261  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.53 
 
 
1071 aa  260  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
1066 aa  258  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  41.1 
 
 
1612 aa  258  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  46.45 
 
 
832 aa  257  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.17 
 
 
1031 aa  256  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 
1112 aa  256  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 
1104 aa  254  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  34.06 
 
 
1064 aa  254  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  34.06 
 
 
1064 aa  254  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  33.47 
 
 
1064 aa  254  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  33.86 
 
 
1064 aa  254  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  34.06 
 
 
1064 aa  254  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  34.06 
 
 
1064 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  34.06 
 
 
1064 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.67 
 
 
1068 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  33.47 
 
 
1064 aa  254  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  33.67 
 
 
1064 aa  253  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  32.21 
 
 
621 aa  253  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.53 
 
 
773 aa  252  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  32.59 
 
 
609 aa  251  7e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
1120 aa  251  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.73 
 
 
663 aa  250  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
1068 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  33.27 
 
 
1084 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1068 aa  249  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  40.25 
 
 
1269 aa  250  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
1055 aa  249  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
1047 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.48 
 
 
1091 aa  248  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.63 
 
 
1088 aa  248  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.63 
 
 
1088 aa  248  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  35.06 
 
 
1047 aa  248  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
1021 aa  248  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  33.92 
 
 
531 aa  247  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  40.72 
 
 
1765 aa  247  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.46 
 
 
1143 aa  247  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
1108 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  43.17 
 
 
868 aa  246  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.84 
 
 
1082 aa  246  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  30.94 
 
 
1178 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 
982 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  32.07 
 
 
648 aa  246  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.31 
 
 
1031 aa  246  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  34.05 
 
 
959 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  31.41 
 
 
918 aa  245  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
1155 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
1090 aa  245  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>