285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04521 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  95.83 
 
 
216 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  91.2 
 
 
216 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  76.85 
 
 
214 aa  341  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 
232 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  43.81 
 
 
235 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  38.39 
 
 
229 aa  194  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 
244 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 
253 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.09 
 
 
239 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  36.15 
 
 
233 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.3 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.88 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  37.82 
 
 
227 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  38.07 
 
 
202 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  35.03 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  35.83 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
204 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 
224 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  37.66 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  33.68 
 
 
262 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  34.69 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  32.12 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  32.82 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.09 
 
 
209 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  31.19 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  32 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  39.87 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  38.25 
 
 
244 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.71 
 
 
231 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  42.86 
 
 
157 aa  128  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  30.96 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  39.47 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  34.05 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  31.88 
 
 
267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  34.97 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  29.38 
 
 
246 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  31.88 
 
 
267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  35.84 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  31.61 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  33.52 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  32.6 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  30.73 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  35.94 
 
 
232 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  30.81 
 
 
220 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
222 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  39.19 
 
 
245 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  30.19 
 
 
236 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  31.69 
 
 
247 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  32.67 
 
 
212 aa  124  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  36.26 
 
 
212 aa  124  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  31.84 
 
 
237 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  34.24 
 
 
223 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  28.5 
 
 
244 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  28.1 
 
 
237 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  32.42 
 
 
255 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  30.96 
 
 
237 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  31.11 
 
 
244 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  31.25 
 
 
218 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  32.58 
 
 
235 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  31.11 
 
 
244 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  33.33 
 
 
199 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.47 
 
 
228 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  34.91 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  30.56 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  32.8 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  34.83 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  34.32 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  34.83 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  31.67 
 
 
231 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 
365 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  36.22 
 
 
251 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  35.48 
 
 
238 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  31.35 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  30.57 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.71 
 
 
383 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  34.34 
 
 
245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  30.57 
 
 
218 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  29.44 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  32.24 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  37.58 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  31.72 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  30.43 
 
 
270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  30.34 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  31.36 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  29.78 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  29.58 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  30.34 
 
 
232 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  32.16 
 
 
216 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  29.11 
 
 
226 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  28 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>