71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3736 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3595  hypothetical protein  81.3 
 
 
529 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3736  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  988    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0978251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  77.19 
 
 
503 aa  722    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3596  hypothetical protein  54.8 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  51.67 
 
 
559 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  40.95 
 
 
498 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2064  hypothetical protein  39.76 
 
 
504 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1900  hypothetical protein  37.7 
 
 
506 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1979  hypothetical protein  39.75 
 
 
507 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0380976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1959  hypothetical protein  39.18 
 
 
488 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159459  normal  0.917261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3737  hypothetical protein  60.68 
 
 
219 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.3 
 
 
810 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
878 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 
632 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
540 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  41.3 
 
 
725 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
713 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.82 
 
 
503 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1276 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.46 
 
 
764 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
767 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.2 
 
 
622 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32 
 
 
560 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.8 
 
 
1677 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
927 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.7 
 
 
739 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
634 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0022  hypothetical protein  25.32 
 
 
529 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
616 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
717 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
708 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
717 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1069 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 
955 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.74 
 
 
725 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
612 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 
1013 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  38.38 
 
 
201 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.46 
 
 
545 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 
723 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 
715 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.46 
 
 
587 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
3560 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
750 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
244 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
352 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2862  hypothetical protein  24.48 
 
 
590 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247941  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
547 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
621 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 
293 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
4079 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  30.93 
 
 
936 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 
245 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.66 
 
 
573 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
573 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
494 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.64 
 
 
739 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.61 
 
 
648 aa  43.5  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
828 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
1737 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
366 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
1061 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
201 aa  43.5  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
505 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>