69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3737 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3737  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  410  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3596  hypothetical protein  91.18 
 
 
498 aa  354  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3595  hypothetical protein  61.84 
 
 
529 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  57.49 
 
 
503 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3736  hypothetical protein  60 
 
 
505 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0978251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  50.98 
 
 
559 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1900  hypothetical protein  41.74 
 
 
506 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1959  hypothetical protein  44.34 
 
 
488 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159459  normal  0.917261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1979  hypothetical protein  41.1 
 
 
507 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0380976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2064  hypothetical protein  41.18 
 
 
504 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  48.21 
 
 
498 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 
955 aa  55.1  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.06 
 
 
564 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  44.16 
 
 
288 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  33.12 
 
 
572 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.84 
 
 
582 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 
632 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
878 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.34 
 
 
764 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 
2240 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.37 
 
 
810 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.34 
 
 
622 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.18 
 
 
865 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
654 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
559 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  31.08 
 
 
559 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
900 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 
574 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.61 
 
 
924 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.32 
 
 
548 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
824 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 
955 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
722 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
594 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
612 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
464 aa  45.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  38.27 
 
 
566 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
613 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.78 
 
 
725 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.57 
 
 
804 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  29.95 
 
 
864 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  35.71 
 
 
551 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.57 
 
 
613 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
718 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
613 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
708 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 
579 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  39.47 
 
 
619 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
583 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
927 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.17 
 
 
603 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
3172 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  35.96 
 
 
989 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.46 
 
 
742 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.46 
 
 
875 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.6 
 
 
573 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 
924 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
567 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 
620 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  35.42 
 
 
725 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
681 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  27.73 
 
 
596 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
581 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
1600 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  34.57 
 
 
545 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
639 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
162 aa  41.6  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>