191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0463 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  95.94 
 
 		 428 aa  710    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  97.61 
 
 		 417 aa  742    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 419 aa  791    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  47.38 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  45.5 
 
 		 409 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  45.26 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  40.57 
 
 		 414 aa  312  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  42.34 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  42.34 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  42.58 
 
 		 414 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  41.01 
 
 		 412 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  41.49 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  41.25 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  41.25 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  42.08 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  37.38 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  40.44 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  35.19 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  40.1 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  39.95 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  34.51 
 
 		 410 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  33.62 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  30.31 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  30.26 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  33.9 
 
 		 506 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  35.29 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  34.32 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  37.68 
 
 		 409 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  41.24 
 
 		 528 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  40.74 
 
 		 517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  36.84 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  35.17 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  33.96 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  30.96 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  35.26 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  35.5 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  32.63 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.33 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  32.91 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  34.76 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  32.58 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  37.97 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  31.04 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  31.6 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  39.72 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  31.6 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  38.99 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  40 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  30.89 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  31.93 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  34.75 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  31.91 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  41.14 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.91 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  31.91 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  31.91 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  31.91 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  31.91 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  31.91 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  36.48 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  30.66 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  27.88 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  31.91 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  31.66 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  31.07 
 
 		 400 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  30.91 
 
 		 400 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  31.57 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  35.73 
 
 		 425 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  31.3 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  33.58 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  34.01 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  32.5 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  32.14 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  38.18 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  28.14 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.49 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  31.21 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.25 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  31.14 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  36.18 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  37.9 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  39.48 
 
 		 418 aa  123  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  37.86 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  39.72 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  31.25 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.27 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  32.53 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.62 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  32.53 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.94 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.97 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  36.15 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  34.66 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  31.75 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  29.3 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.7 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  36.21 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  38.44 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  37.68 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>