252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0234 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
546 aa  1113    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
546 aa  1113    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0631  flagellar MS-ring protein  98.17 
 
 
546 aa  1094    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0250  flagellar MS-ring protein  46.45 
 
 
548 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3382  flagellar MS-ring protein  46.17 
 
 
548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.275908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  39.79 
 
 
559 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  38.54 
 
 
569 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  36.74 
 
 
551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 
566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  37.81 
 
 
583 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  37.36 
 
 
548 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0223  flagellar MS-ring protein  37.52 
 
 
532 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  36.06 
 
 
565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  34.08 
 
 
570 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  36.06 
 
 
558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  36.17 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 
582 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  31.15 
 
 
592 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
597 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
592 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  31.03 
 
 
598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  34.96 
 
 
561 aa  243  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 
556 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  30.27 
 
 
595 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  30.55 
 
 
552 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  31.21 
 
 
592 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  32.1 
 
 
590 aa  230  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  31.04 
 
 
594 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  29.58 
 
 
594 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  29.45 
 
 
594 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.32 
 
 
587 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  29.86 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  29.68 
 
 
544 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.97 
 
 
580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  30.22 
 
 
558 aa  213  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  32.35 
 
 
587 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  32.35 
 
 
587 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  32.35 
 
 
587 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 
587 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  29.5 
 
 
600 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  32.65 
 
 
587 aa  211  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 
587 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 
568 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 
677 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.4 
 
 
603 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  32.13 
 
 
598 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  29.67 
 
 
552 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  32.13 
 
 
598 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.13 
 
 
598 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  29.14 
 
 
611 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  29.86 
 
 
567 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  29.14 
 
 
611 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.89 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 
598 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 
598 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 
598 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 
598 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  29.72 
 
 
611 aa  200  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  31.88 
 
 
560 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  29.56 
 
 
548 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  31.98 
 
 
594 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 
579 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  29.77 
 
 
567 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 
576 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  29 
 
 
574 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 
579 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 
579 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 
579 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  29 
 
 
574 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  27.97 
 
 
570 aa  188  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  27.97 
 
 
570 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 
548 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
593 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  27.97 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  31.87 
 
 
576 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  29.17 
 
 
552 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  29.17 
 
 
552 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  29.17 
 
 
552 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  28.21 
 
 
569 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  29.17 
 
 
552 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  29.17 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  27.18 
 
 
584 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  29.78 
 
 
553 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 
560 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 
560 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  29 
 
 
552 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  27.87 
 
 
563 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  28.38 
 
 
565 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  29.17 
 
 
568 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  26.97 
 
 
576 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  29.15 
 
 
561 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  29.15 
 
 
561 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 
560 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  26.65 
 
 
568 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  28.97 
 
 
561 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  29.98 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  28.33 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  30.1 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  28.38 
 
 
560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.739172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>