More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2473 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  71.84 
 
 
305 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  70.12 
 
 
315 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  67.44 
 
 
260 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  68.53 
 
 
301 aa  350  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  70.08 
 
 
255 aa  346  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  64.94 
 
 
274 aa  333  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  64.94 
 
 
289 aa  333  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  65.74 
 
 
269 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  65.75 
 
 
274 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  63.64 
 
 
271 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  64.9 
 
 
282 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  66.14 
 
 
316 aa  326  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  64.14 
 
 
274 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  65.56 
 
 
294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  61.96 
 
 
267 aa  311  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  61.11 
 
 
267 aa  308  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  58.89 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  58.27 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 
259 aa  301  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
264 aa  297  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  54.98 
 
 
265 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  56.3 
 
 
280 aa  293  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  54.76 
 
 
266 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  54.37 
 
 
262 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  54.33 
 
 
282 aa  280  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  54.37 
 
 
267 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
266 aa  274  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  51.98 
 
 
266 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.82 
 
 
278 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  52.82 
 
 
288 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  52.38 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  52.78 
 
 
262 aa  263  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  50.4 
 
 
264 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  49.02 
 
 
266 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  48.55 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.87 
 
 
265 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  45.24 
 
 
273 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  44.8 
 
 
260 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.72 
 
 
265 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
265 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.35 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.92 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 
274 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.2 
 
 
259 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  43.9 
 
 
260 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  43.5 
 
 
265 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  43.62 
 
 
259 aa  191  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
260 aa  191  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.84 
 
 
272 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42 
 
 
265 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.51 
 
 
268 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  45.38 
 
 
253 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  40.98 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  41.9 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 
258 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.4 
 
 
264 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  43.08 
 
 
263 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  42.06 
 
 
260 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
275 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
266 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
260 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 
263 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  42.51 
 
 
260 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.87 
 
 
254 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  45.93 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.15 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.12 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.17 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  42.91 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.19 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.9 
 
 
261 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  42.39 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
250 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.09 
 
 
255 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  42.4 
 
 
265 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  41.02 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
265 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  43.39 
 
 
258 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  41.98 
 
 
265 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.21 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  40 
 
 
260 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  39.5 
 
 
245 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.98 
 
 
257 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
261 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.16 
 
 
243 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
276 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
283 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  38.02 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>