More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1772 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  310  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  42.66 
 
 
160 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  38.78 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  36.6 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  36.6 
 
 
153 aa  94.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 
151 aa  94.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.36 
 
 
149 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  35.53 
 
 
151 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  36.17 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  34.18 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.97 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  34.18 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  37.78 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  42.28 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  37.04 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  38.71 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  29.93 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.43 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  36.13 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  31.47 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  30.22 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  30.22 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
237 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.85 
 
 
624 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  30.22 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.72 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.99 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.54 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  27.81 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  33.09 
 
 
410 aa  64.7  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  29.03 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.9 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  31.34 
 
 
1043 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
234 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.09 
 
 
413 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.06 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.56 
 
 
225 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
252 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
225 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
225 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
240 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  27.82 
 
 
230 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 
242 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  34.07 
 
 
621 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.94 
 
 
223 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 
435 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
219 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
234 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.75 
 
 
226 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.2 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.75 
 
 
228 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.23 
 
 
226 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  32.17 
 
 
747 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
225 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
286 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
230 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 
238 aa  58.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 
225 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 
234 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  26.47 
 
 
1408 aa  57.4  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
226 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
228 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.85 
 
 
225 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 
561 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.12 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.16 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.03 
 
 
419 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.36 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.89 
 
 
243 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.27 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  31.39 
 
 
594 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  28.15 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.15 
 
 
231 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
238 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>