More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2755 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  80.18 
 
 		 222 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  77.83 
 
 		 223 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  77.83 
 
 		 223 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  73.64 
 
 		 222 aa  322  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  70 
 
 		 222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  57.67 
 
 		 244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 233 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  51.42 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  46.8 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  47.52 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 211 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  43.72 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.39 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  38.92 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.63 
 
 		 230 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  41.01 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>