More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3859 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  43.73 
 
 		 841 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  43.99 
 
 		 841 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  43.55 
 
 		 838 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  84.84 
 
 		 975 aa  1357    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 901 aa  1865    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  43.99 
 
 		 841 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  85.83 
 
 		 886 aa  1374    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  55.77 
 
 		 774 aa  622  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  55.58 
 
 		 748 aa  618  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  55.58 
 
 		 907 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  55 
 
 		 788 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  56.16 
 
 		 730 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  54.46 
 
 		 778 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  54.81 
 
 		 755 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  54.26 
 
 		 794 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  54.42 
 
 		 756 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  54.62 
 
 		 572 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  53.14 
 
 		 792 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  54.47 
 
 		 785 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  40.87 
 
 		 845 aa  552  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  39.71 
 
 		 843 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  39.53 
 
 		 845 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  41.32 
 
 		 834 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  41.32 
 
 		 834 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  41.19 
 
 		 834 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 		 910 aa  515  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  39.47 
 
 		 826 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  40.72 
 
 		 865 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  39.16 
 
 		 968 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  49.02 
 
 		 796 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  48.18 
 
 		 734 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  48.18 
 
 		 734 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  48.18 
 
 		 734 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  48.18 
 
 		 734 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  48.18 
 
 		 734 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  48.18 
 
 		 734 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  39.72 
 
 		 907 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  37.62 
 
 		 846 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  48.26 
 
 		 731 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  38.55 
 
 		 885 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  48.07 
 
 		 731 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  48.42 
 
 		 757 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  47.35 
 
 		 780 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  48.02 
 
 		 734 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  38.03 
 
 		 734 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  36.3 
 
 		 822 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  47.35 
 
 		 777 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  36.02 
 
 		 1284 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  45.75 
 
 		 687 aa  446  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  35.58 
 
 		 1284 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  33.55 
 
 		 920 aa  439  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  44.71 
 
 		 769 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  45.69 
 
 		 645 aa  439  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  34.41 
 
 		 885 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  35.14 
 
 		 837 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  36.44 
 
 		 889 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  37.2 
 
 		 890 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  35.73 
 
 		 741 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  45.04 
 
 		 741 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.68 
 
 		 735 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  34.75 
 
 		 924 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  35.82 
 
 		 712 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  34.36 
 
 		 918 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  33.37 
 
 		 912 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  42.97 
 
 		 689 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  33.49 
 
 		 952 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  34.06 
 
 		 855 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  43.37 
 
 		 689 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  32.47 
 
 		 840 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  33.46 
 
 		 941 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  40.43 
 
 		 753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  40.95 
 
 		 646 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  31.54 
 
 		 1048 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  41.6 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.98 
 
 		 958 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  40.44 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  40.44 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  40.18 
 
 		 775 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  40.44 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  40.18 
 
 		 775 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  40.18 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  40.44 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  42.15 
 
 		 741 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  41.42 
 
 		 730 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.05 
 
 		 853 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  41.9 
 
 		 729 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 871 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  41.9 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  42.09 
 
 		 743 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 869 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.64 
 
 		 851 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.62 
 
 		 875 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  40.46 
 
 		 714 aa  383  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  42.83 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  30.89 
 
 		 862 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  33.06 
 
 		 862 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  42.83 
 
 		 767 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 		 676 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 		 725 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  32.98 
 
 		 842 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>