More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0587 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05392  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  31.53 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  30.52 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.86 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.2 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 543 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 		 542 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 544 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  35.2 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 498 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 374 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 623 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 510 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  36.43 
 
 		 261 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.81 
 
 		 319 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  36.43 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  36.43 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  36.43 
 
 		 316 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  36.43 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  36.43 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  36.43 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  36.43 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 388 aa  84.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 525 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  35.66 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  28.97 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  31.21 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  35.66 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 704 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.87 
 
 		 1026 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  33.58 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.63 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  28.66 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.71 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  36.94 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.47 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  35.16 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  32.56 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 630 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 537 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  36.79 
 
 		 318 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.3 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 427 aa  78.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.3 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.1 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32.81 
 
 		 420 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 420 aa  78.2  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1987 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.52 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.97 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  33.96 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  30.68 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  31.25 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  32.85 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 1755 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  31.11 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.1 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.64 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.94 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.04 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.07 
 
 		 620 aa  75.9  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.86 
 
 		 670 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 386 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  34.17 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.79 
 
 		 429 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 586 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  27.1 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>