More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03390 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  100 
 
 		 448 aa  895    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  86.1 
 
 		 448 aa  800    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  69.52 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  46.15 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  46.46 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  43.76 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  43.6 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  32.94 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  32.94 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  33.25 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  33.25 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  32.11 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  32.86 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  34.12 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.7 
 
 		 451 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  31.97 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  33.25 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  32.41 
 
 		 448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  32.23 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  33.86 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  34.26 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  33.1 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  32.49 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 442 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 455 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 447 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 451 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  31.93 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  31.93 
 
 		 451 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  31.7 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 454 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  31.24 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  31.24 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.31 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.54 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 456 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.52 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 447 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.87 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.64 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.34 
 
 		 456 aa  166  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.68 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 493 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.27 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.35 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.96 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.71 
 
 		 496 aa  156  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 447 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.19 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.63 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 460 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  25.74 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.06 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  24.59 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.36 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  26.71 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>