More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0659 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
431 aa  850    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
427 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
421 aa  299  7e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
419 aa  293  4e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
417 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
415 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
439 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
418 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
418 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
418 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
418 aa  240  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
409 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
418 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
434 aa  230  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
432 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
410 aa  227  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
436 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
421 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
442 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
434 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  34.47 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
442 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
420 aa  212  9e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
453 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
454 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
421 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
432 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
377 aa  210  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
418 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
410 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
408 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
434 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
430 aa  203  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
420 aa  203  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
433 aa  200  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
419 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
467 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
462 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
506 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
437 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
439 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
462 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  37.08 
 
 
401 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
470 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
424 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
453 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
415 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
419 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
420 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
494 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
497 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  32.13 
 
 
525 aa  192  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
423 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
423 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
466 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
457 aa  191  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
423 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
423 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
494 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
494 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
418 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
423 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
423 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
423 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
423 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
423 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
415 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
427 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
423 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  32.88 
 
 
438 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
465 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
423 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 
423 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
498 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
423 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  29.59 
 
 
422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 
543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>