More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3943 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  28.67 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  34.78 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  34.65 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  45.16 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>