More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2322 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 371 aa  714    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.73 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  39.08 
 
 		 349 aa  235  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  38.38 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  38.58 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 360 aa  222  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.84 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  38.44 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  38.44 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  38.77 
 
 		 361 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  38.14 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  37.2 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  40.18 
 
 		 361 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  43.14 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.98 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  39.66 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  41.5 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  42.66 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  34.42 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  36.94 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  38.64 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.94 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  32.68 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  31.27 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.19 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  34.77 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.72 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.13 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  34.15 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  37.33 
 
 		 403 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  29.19 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  31.71 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  35.17 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  28.28 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.72 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.08 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 389 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  27.88 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  31.04 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.75 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  28.28 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  29.08 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  33 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.73 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  32.07 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  28.09 
 
 		 427 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  26.8 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  30.24 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  30.74 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.76 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  29.72 
 
 		 406 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.51 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  29.75 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  30.25 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.22 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  27.56 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1365  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000256097  hitchhiker  0.000707959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>