222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11080 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  68.31 
 
 
301 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  68.31 
 
 
301 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  68.31 
 
 
301 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  64.93 
 
 
288 aa  359  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  68.68 
 
 
288 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  43.17 
 
 
276 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  44.87 
 
 
283 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  35.5 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  40 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  33.91 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  36.12 
 
 
331 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  43.13 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  35.04 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  34.27 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  40.28 
 
 
284 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  32.23 
 
 
330 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  32.78 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  37.5 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  32.05 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  32.79 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  34.21 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  32.69 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  31.58 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  32.37 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.19 
 
 
377 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.11 
 
 
748 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  29.52 
 
 
411 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  25.67 
 
 
377 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  31.58 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.51 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.19 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  29.19 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.99 
 
 
753 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  29.19 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.62 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  36.17 
 
 
145 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.44 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.77 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.22 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  28.5 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  27.83 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  36.32 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.14 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  26.04 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.19 
 
 
253 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  25.36 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.72 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.25 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  40.23 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.44 
 
 
803 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.44 
 
 
803 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.44 
 
 
803 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.7 
 
 
323 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.84 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  28.92 
 
 
358 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.52 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  25.6 
 
 
263 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  31.58 
 
 
216 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  25.46 
 
 
256 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.26 
 
 
324 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  29.52 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.78 
 
 
790 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  28.12 
 
 
754 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  28.97 
 
 
798 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  28.63 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  27.66 
 
 
667 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.39 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.77 
 
 
727 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  28.97 
 
 
804 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  32.27 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  30.14 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  26.56 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.97 
 
 
796 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  31.16 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.48 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  32.27 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.14 
 
 
777 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  29.58 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.75 
 
 
347 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.15 
 
 
813 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  43.06 
 
 
745 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  33.04 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  39.44 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  39.44 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  39.44 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.71 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.71 
 
 
474 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  29.82 
 
 
707 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  37.88 
 
 
379 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.17 
 
 
728 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.71 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.71 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  39.44 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  33.91 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.71 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.76 
 
 
330 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  26.76 
 
 
341 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  30.46 
 
 
347 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>