More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0001 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
390 aa  786  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  59.79 
 
 
387 aa  460  1e-128  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  59.01 
 
 
382 aa  460  1e-128  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  57.4 
 
 
393 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  57.4 
 
 
393 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  2.81863e-09 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  54.82 
 
 
394 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  58.18 
 
 
385 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  56.36 
 
 
385 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  56.7 
 
 
388 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  52.21 
 
 
397 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  52.91 
 
 
374 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  5.79402e-05  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  47.29 
 
 
385 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  45.08 
 
 
385 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  45.08 
 
 
385 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  47.93 
 
 
386 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  47.29 
 
 
385 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  33.86 
 
 
376 aa  219  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  33.16 
 
 
444 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  54.7 
 
 
200 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 
377 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 
366 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  32.99 
 
 
479 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 
370 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  33.25 
 
 
378 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  31.93 
 
 
378 aa  201  2e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  32.19 
 
 
378 aa  201  2e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.71 
 
 
365 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 
378 aa  201  2e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  32.37 
 
 
377 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.56 
 
 
375 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 
367 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.56 
 
 
366 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.16 
 
 
369 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  33.07 
 
 
381 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.66783e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.36 
 
 
366 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  31.58 
 
 
373 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 
397 aa  185  1e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 
374 aa  184  2e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 
372 aa  184  2e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 
397 aa  184  2e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 
381 aa  181  3e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  31.05 
 
 
367 aa  179  6e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.63 
 
 
372 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.29 
 
 
373 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  30.08 
 
 
385 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.63 
 
 
372 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.46 
 
 
370 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.29 
 
 
374 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
379 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 
380 aa  176  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  29.09 
 
 
381 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.09 
 
 
381 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
379 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
379 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 
381 aa  175  1e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
377 aa  175  1e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
379 aa  175  1e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
377 aa  175  1e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.05 
 
 
375 aa  174  2e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
379 aa  174  2e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.29 
 
 
378 aa  174  2e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.73 
 
 
367 aa  174  3e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
373 aa  173  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  9.29484e-07 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 
365 aa  173  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  5.99685e-05 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 
374 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  1.16577e-06 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.34 
 
 
375 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
379 aa  173  6e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.89 
 
 
372 aa  173  6e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.79 
 
 
375 aa  173  6e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
379 aa  173  6e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.44 
 
 
372 aa  172  7e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 
372 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
371 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  1.94465e-05  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.82 
 
 
372 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 
365 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 
377 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 
372 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.13 
 
 
372 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  29.82 
 
 
372 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 
372 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 
366 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 
366 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.47 
 
 
366 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  30.03 
 
 
371 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.2 
 
 
378 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.73 
 
 
366 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 
375 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.79 
 
 
369 aa  167  3e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 
372 aa  167  3e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.78 
 
 
372 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  29.29 
 
 
412 aa  166  6e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 
376 aa  165  1e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.39 
 
 
378 aa  165  1e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 
367 aa  165  1e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  25.59 
 
 
376 aa  165  1e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  25.59 
 
 
376 aa  165  1e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  31.32 
 
 
372 aa  165  1e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 
376 aa  165  1e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  25.59 
 
 
376 aa  164  2e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>