232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5753 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  62.9 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  39.6 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  52.94 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  31.69 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  43.06 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 354 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  37.21 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 189 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 335 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 352 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 198 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  37.93 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  40.74 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  38.33 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  39.29 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>