More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3734 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  77.18 
 
 		 514 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 497 aa  939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  49.9 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  51.65 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 526 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  50.32 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.5 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  50.96 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 562 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  50 
 
 		 540 aa  360  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  52.49 
 
 		 502 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  48.96 
 
 		 496 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 528 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 514 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  51.28 
 
 		 528 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 529 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 575 aa  332  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  46.36 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 584 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 		 509 aa  329  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  42.8 
 
 		 541 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  44.94 
 
 		 554 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  42.62 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 532 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 533 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 		 490 aa  302  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  43.83 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.63 
 
 		 537 aa  292  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 		 521 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 601 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 513 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 555 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 519 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.41 
 
 		 516 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.17 
 
 		 492 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 508 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 517 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.68 
 
 		 500 aa  246  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.41 
 
 		 505 aa  236  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  37.34 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.66 
 
 		 522 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 510 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 534 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.11 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 516 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 500 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.66 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  36.44 
 
 		 528 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.99 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 607 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.92 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 594 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 514 aa  206  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.99 
 
 		 532 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 496 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  37.88 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  34.62 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  34.41 
 
 		 495 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  34.41 
 
 		 495 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>