179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1919 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  100 
 
 
680 aa  1384    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  67.45 
 
 
376 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  41.67 
 
 
648 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  47.83 
 
 
360 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  47.83 
 
 
360 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  47.83 
 
 
360 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  47.54 
 
 
360 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  47.54 
 
 
360 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 
360 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  47.21 
 
 
360 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  46.67 
 
 
360 aa  293  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  46.67 
 
 
360 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  40.26 
 
 
1362 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  35.97 
 
 
613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  37.44 
 
 
846 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  37.44 
 
 
848 aa  223  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  37.31 
 
 
846 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  38.71 
 
 
543 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  35.18 
 
 
846 aa  219  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 
551 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 
1578 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  61.59 
 
 
245 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  62.99 
 
 
490 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.46 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  33.43 
 
 
341 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  35.09 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  33.13 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  32.97 
 
 
460 aa  160  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  35.28 
 
 
467 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  48.31 
 
 
174 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  53.05 
 
 
261 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  65.67 
 
 
526 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  52.41 
 
 
516 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  53.85 
 
 
551 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  43.36 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.29 
 
 
782 aa  104  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.3 
 
 
782 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  47.37 
 
 
763 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  47.37 
 
 
591 aa  99.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  28.45 
 
 
492 aa  95.9  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  27.22 
 
 
729 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  27.22 
 
 
729 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  26.65 
 
 
699 aa  93.2  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  27.38 
 
 
565 aa  92.8  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.27 
 
 
6885 aa  91.3  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.76 
 
 
483 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  27.45 
 
 
483 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  25.82 
 
 
471 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
471 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  26.13 
 
 
598 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 
484 aa  87.8  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
727 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  25.75 
 
 
353 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.2 
 
 
803 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  33.49 
 
 
1795 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  34.46 
 
 
2170 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  41.43 
 
 
1462 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  39.2 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  35.98 
 
 
1628 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  38.35 
 
 
1199 aa  75.5  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.4 
 
 
1067 aa  75.5  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  34 
 
 
3802 aa  74.7  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  37.91 
 
 
692 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  30.73 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  27.08 
 
 
1113 aa  73.2  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  36.56 
 
 
782 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.56 
 
 
743 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
1137 aa  71.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  38.14 
 
 
1880 aa  71.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  42.01 
 
 
683 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  30.22 
 
 
1172 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  57.32 
 
 
1209 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  40.54 
 
 
1160 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.65 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  26.71 
 
 
703 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  53.85 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  32.65 
 
 
445 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  30.68 
 
 
561 aa  64.3  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.15 
 
 
455 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  29.15 
 
 
456 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  29.14 
 
 
514 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.66 
 
 
1121 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
211 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.38 
 
 
455 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  34.32 
 
 
973 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  34.21 
 
 
428 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  53.85 
 
 
492 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  31.09 
 
 
455 aa  60.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.52 
 
 
455 aa  60.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.98 
 
 
455 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.98 
 
 
455 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  49.43 
 
 
1298 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  30.49 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>