More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1407 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  868    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  62.42 
 
 
440 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  60.44 
 
 
454 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  63.54 
 
 
449 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  62.93 
 
 
449 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  62.93 
 
 
449 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  60.88 
 
 
441 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  64.11 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  65.1 
 
 
434 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  59.57 
 
 
433 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  54.32 
 
 
457 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  54.17 
 
 
432 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  53.63 
 
 
431 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  52.97 
 
 
430 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  51.95 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  47.05 
 
 
436 aa  356  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  58.8 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  49.8 
 
 
473 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  52.31 
 
 
412 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  52.66 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  51.43 
 
 
430 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  54.07 
 
 
430 aa  340  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  46.05 
 
 
430 aa  299  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  47.09 
 
 
432 aa  292  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  32.89 
 
 
436 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.46 
 
 
469 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.87 
 
 
440 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.29 
 
 
436 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 
444 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.46 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.93 
 
 
450 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.49 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  28.49 
 
 
436 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  28.84 
 
 
436 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.1 
 
 
444 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.78 
 
 
444 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.49 
 
 
458 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.88 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.91 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.99 
 
 
429 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.17 
 
 
446 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.39 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.15 
 
 
448 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.65 
 
 
444 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  29.57 
 
 
443 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  30.08 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.86 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.48 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.43 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.25 
 
 
443 aa  106  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.7 
 
 
444 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.17 
 
 
296 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.91 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.79 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.34 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.4 
 
 
316 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.26 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.3 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.35 
 
 
296 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.15 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.94 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 
309 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  20.86 
 
 
290 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.54 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  55.17 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  44.93 
 
 
295 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  29.6 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.17 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.37 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  25.71 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  30.7 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  32.33 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.23 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  23.72 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.76 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  46.67 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  22.08 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  48.39 
 
 
331 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  44 
 
 
309 aa  67  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.67 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.23 
 
 
303 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  31.86 
 
 
314 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  20 
 
 
276 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  36.75 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  41.43 
 
 
286 aa  65.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  21.3 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  29.48 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  46.97 
 
 
286 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.65 
 
 
314 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  43.33 
 
 
311 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.11 
 
 
330 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.67 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  40 
 
 
317 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  35.2 
 
 
546 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>