More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4738 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  60.28 
 
 
1038 aa  1184  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1004 aa  2034  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  61.49 
 
 
1028 aa  1220  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  79.22 
 
 
1033 aa  1565  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  39.27 
 
 
983 aa  636  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  60.53 
 
 
1055 aa  1206  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  39.38 
 
 
991 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  39.29 
 
 
995 aa  615  1e-174  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  37.81 
 
 
1001 aa  577  1e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  36.9 
 
 
1001 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.24 
 
 
1125 aa  445  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  32.78 
 
 
995 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  32.57 
 
 
986 aa  350  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.1 
 
 
1006 aa  334  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  37.99 
 
 
1119 aa  332  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  41.01 
 
 
1131 aa  323  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  41.01 
 
 
1129 aa  323  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  40.81 
 
 
1131 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  40.81 
 
 
1131 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  40.81 
 
 
1129 aa  322  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  40.81 
 
 
1131 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  39.07 
 
 
1130 aa  321  4e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  41.21 
 
 
1131 aa  316  1e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.95 
 
 
1508 aa  313  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  35.57 
 
 
650 aa  312  3e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  37.8 
 
 
2396 aa  310  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 
2365 aa  310  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.07 
 
 
1029 aa  310  1e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 
2346 aa  309  2e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  37.24 
 
 
2366 aa  300  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  37.24 
 
 
2371 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  35.45 
 
 
1550 aa  286  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.02 
 
 
1227 aa  286  2e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  36.68 
 
 
3506 aa  283  8e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.13 
 
 
1011 aa  277  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.17 
 
 
2003 aa  272  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.9 
 
 
4238 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  33.73 
 
 
4238 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.9 
 
 
3822 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.91 
 
 
919 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.98 
 
 
990 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.58 
 
 
1285 aa  258  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.06 
 
 
3954 aa  252  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  33.73 
 
 
1056 aa  252  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.39 
 
 
972 aa  250  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  33.76 
 
 
1881 aa  248  5e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.11 
 
 
1848 aa  242  3e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.68 
 
 
1164 aa  241  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  31.36 
 
 
1053 aa  239  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  32.59 
 
 
677 aa  230  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.3 
 
 
915 aa  226  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  32.08 
 
 
1782 aa  216  2e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.07 
 
 
985 aa  216  2e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  32.1 
 
 
1062 aa  211  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.7 
 
 
913 aa  210  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.3 
 
 
1519 aa  210  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.99 
 
 
1333 aa  206  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.71 
 
 
910 aa  198  4e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  35.81 
 
 
1016 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  29.74 
 
 
1152 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.34 
 
 
926 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.74 
 
 
1011 aa  188  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.47 
 
 
942 aa  187  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.59 
 
 
906 aa  185  4e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.19199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  27.43 
 
 
954 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  28.16 
 
 
970 aa  182  3e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  3.19801e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  29.66 
 
 
994 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  31.55 
 
 
816 aa  180  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  27.17 
 
 
965 aa  180  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.79 
 
 
947 aa  178  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  27.75 
 
 
949 aa  177  1e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  4.85293e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  27.31 
 
 
970 aa  175  4e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  26.88 
 
 
998 aa  175  4e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  25.65 
 
 
974 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  29.67 
 
 
980 aa  166  2e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  27.38 
 
 
909 aa  162  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  31.43 
 
 
1446 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.71 
 
 
1179 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.25 
 
 
1156 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 
959 aa  160  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  28 
 
 
2711 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.12 
 
 
1177 aa  148  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.98 
 
 
1154 aa  147  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.93 
 
 
1134 aa  142  4e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  31.52 
 
 
488 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.63 
 
 
1081 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.27 
 
 
710 aa  130  1e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  26.01 
 
 
911 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.22 
 
 
1769 aa  122  4e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.77 
 
 
1532 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  27.54 
 
 
1325 aa  116  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.66 
 
 
1489 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.88 
 
 
979 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 
407 aa  108  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  25.33 
 
 
1121 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25 
 
 
1066 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  42.58 
 
 
987 aa  101  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.89 
 
 
1322 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  27.78 
 
 
1175 aa  99  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.48 
 
 
1459 aa  99  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>