More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2539 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  100 
 
 		 368 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  52.69 
 
 		 407 aa  401  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  47.51 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  47.63 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  44.07 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  41.16 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  37.64 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  37.36 
 
 		 363 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.99 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  33.72 
 
 		 427 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 392 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 377 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  27 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.08 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30.54 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.89 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.89 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  27.22 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.4 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  26.91 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.91 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  24.15 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  26.25 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  23.48 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  24 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.43 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  27.2 
 
 		 517 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.85 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  24.86 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 689 aa  87.8  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.74 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.96 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.22 
 
 		 483 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.78 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.93 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.62 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  22.61 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.16 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  27.88 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  23.24 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  21.61 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  26.63 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.56 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  20.81 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>