More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4194 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  700    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  63.42 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 335 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  57.73 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  57.73 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  57.73 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  35.98 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 324 aa  179  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.03 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.62 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.05 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.15 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 331 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  28.99 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.21 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  31.9 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  35.04 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 351 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  41.21 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  33.17 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  29.18 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  28.4 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.66 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.7 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  31.42 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  30.64 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 361 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  32.34 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0228  ThiJ/PfpI domain protein  29.81 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000506965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>