More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2193 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0100  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.27 
 
 
1049 aa  762  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0931  multidrug-efflux transporter  40.47 
 
 
1055 aa  774  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.67 
 
 
1061 aa  764  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.11 
 
 
1066 aa  766  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.39 
 
 
1040 aa  887  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0132  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.12 
 
 
1045 aa  762  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4473  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.21 
 
 
1052 aa  786  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.02 
 
 
1059 aa  784  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.3 
 
 
1050 aa  803  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.25 
 
 
1037 aa  816  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  41.62 
 
 
1049 aa  793  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.62 
 
 
1049 aa  793  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.16 
 
 
1037 aa  816  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.41 
 
 
1034 aa  785  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3718  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.07 
 
 
1041 aa  771  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.03 
 
 
1050 aa  781  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.83 
 
 
1043 aa  813  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3632  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.72 
 
 
1047 aa  773  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.840793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.51 
 
 
1061 aa  774  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.03 
 
 
1058 aa  805  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1068  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.36 
 
 
1052 aa  787  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.923485  hitchhiker  0.00533335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1392  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.25 
 
 
1049 aa  782  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.14 
 
 
1050 aa  769  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0842  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.96 
 
 
1051 aa  762  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.823151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3257  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.03 
 
 
1073 aa  796  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662335  normal  0.89676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.4 
 
 
1055 aa  840  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  41.62 
 
 
1049 aa  792  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.72 
 
 
1089 aa  775  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.44 
 
 
1061 aa  762  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730926  normal  0.35721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.72 
 
 
1089 aa  775  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.78 
 
 
1064 aa  793  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.04 
 
 
1063 aa  764  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.17 
 
 
1062 aa  786  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.34 
 
 
1055 aa  771  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.77 
 
 
1066 aa  775  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.11 
 
 
1066 aa  766  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.72 
 
 
1049 aa  793  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.52 
 
 
1047 aa  799  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.51 
 
 
1050 aa  788  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  41.41 
 
 
1034 aa  784  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.96 
 
 
1037 aa  814  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  41.62 
 
 
1049 aa  793  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  41.5 
 
 
1034 aa  787  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.25 
 
 
1037 aa  819  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  41.62 
 
 
1049 aa  793  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0531  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.45 
 
 
1044 aa  771  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606405 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1775  acriflavine resistance protein B  39.96 
 
 
1051 aa  764  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00032562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3585  RND efflux transporter  41.07 
 
 
1041 aa  771  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3068  acriflavine resistance protein B  41.03 
 
 
1050 aa  781  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.24086e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1268  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.83 
 
 
1043 aa  813  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0668  RND efflux transporter  41.06 
 
 
1039 aa  779  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1591  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  40.43 
 
 
1040 aa  795  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.19 
 
 
1054 aa  780  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4054  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.63 
 
 
1057 aa  795  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.422503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2877  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.43 
 
 
1061 aa  765  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  40.02 
 
 
1041 aa  764  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.87 
 
 
1038 aa  873  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  89 
 
 
1055 aa  1857  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.3 
 
 
1059 aa  791  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3326  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.7 
 
 
1054 aa  777  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.775486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.94 
 
 
1063 aa  766  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4007  RND efflux transporter  40.98 
 
 
1041 aa  770  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  41.03 
 
 
1050 aa  781  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.83 
 
 
1085 aa  812  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.87 
 
 
1061 aa  778  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.3 
 
 
1066 aa  770  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.44 
 
 
1046 aa  792  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3368  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.23 
 
 
1065 aa  780  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.65 
 
 
1051 aa  775  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.08 
 
 
1044 aa  775  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  100 
 
 
1044 aa  2113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.28 
 
 
1043 aa  876  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.01 
 
 
1033 aa  805  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.76 
 
 
1048 aa  765  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.88 
 
 
1049 aa  862  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.71 
 
 
1065 aa  814  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02323  hypothetical protein  40.16 
 
 
1037 aa  816  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00418  hypothetical protein  41.62 
 
 
1049 aa  793  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2511  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.33 
 
 
1052 aa  774  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1010  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.81 
 
 
1047 aa  768  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.23 
 
 
1050 aa  772  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.46 
 
 
1062 aa  772  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.71 
 
 
1050 aa  782  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.18 
 
 
1054 aa  768  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  40.7 
 
 
1069 aa  766  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  42.28 
 
 
1057 aa  797  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  41.37 
 
 
1040 aa  803  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2326  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.79 
 
 
1055 aa  766  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1153  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.48 
 
 
1058 aa  781  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0942  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.02 
 
 
1077 aa  768  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26246  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.76 
 
 
1066 aa  767  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5152  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.9 
 
 
1055 aa  793  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03075  hypothetical protein  41.41 
 
 
1034 aa  785  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3048  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.21 
 
 
1047 aa  781  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0601242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1069  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.17 
 
 
1042 aa  780  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1621  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.54 
 
 
1048 aa  767  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557587  normal  0.228387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6591  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.71 
 
 
1072 aa  788  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0821  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.78 
 
 
1062 aa  798  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265502  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.47 
 
 
1042 aa  860  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.32541e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001386  cation/multidrug efflux pump  42.8 
 
 
1027 aa  827  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>