More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0010 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  79.46 
 
 
1062 aa  1790  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  78.43 
 
 
1049 aa  1755  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  80.69 
 
 
445 aa  752  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  85.18 
 
 
1069 aa  1903  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  78.9 
 
 
1062 aa  1780  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  79.83 
 
 
1062 aa  1791  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.11997e-06 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  50.43 
 
 
1111 aa  1077  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  81.65 
 
 
1067 aa  1832  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  79.18 
 
 
1062 aa  1786  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.93716e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  78.99 
 
 
1062 aa  1781  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  45.21 
 
 
1078 aa  985  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  76.57 
 
 
1062 aa  1742  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  50.67 
 
 
1138 aa  1134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  80.4 
 
 
598 aa  1017  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  48.91 
 
 
1113 aa  1050  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  48.08 
 
 
1084 aa  1014  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  100 
 
 
1066 aa  2204  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  84.77 
 
 
1081 aa  1914  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72228e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  45.98 
 
 
1062 aa  1029  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  79.98 
 
 
1060 aa  1806  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  78.34 
 
 
1062 aa  1772  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  9.34915e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  79.93 
 
 
1062 aa  1797  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  78.2 
 
 
1065 aa  1756  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.14616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  62.18 
 
 
1071 aa  1384  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.17 
 
 
1052 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  2.34818e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.12 
 
 
1005 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.57 
 
 
1059 aa  237  1e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.4 
 
 
1014 aa  220  9e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.07 
 
 
1042 aa  215  3e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.77 
 
 
1040 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.55 
 
 
1042 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.95 
 
 
1010 aa  185  5e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.88 
 
 
1031 aa  177  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.44 
 
 
1097 aa  115  4e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26.28 
 
 
1090 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.95 
 
 
1082 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.5 
 
 
1067 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  24.56 
 
 
686 aa  102  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.59 
 
 
440 aa  101  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.91 
 
 
496 aa  97.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.24 
 
 
478 aa  97.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  24.01 
 
 
666 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.2 
 
 
438 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.82 
 
 
717 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.29 
 
 
430 aa  90.5  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.28 
 
 
1076 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  26.05 
 
 
413 aa  87  2e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.26 
 
 
680 aa  85.9  4e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  25.81 
 
 
413 aa  85.5  5e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  22.47 
 
 
1167 aa  85.5  6e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.91 
 
 
427 aa  84.7  8e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.68 
 
 
437 aa  84  1e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  25.18 
 
 
470 aa  84.3  1e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.6 
 
 
1084 aa  84  2e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.82269e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.25 
 
 
1125 aa  83.6  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.27 
 
 
413 aa  82.8  3e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 
969 aa  83.2  3e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  35.29 
 
 
426 aa  82  5e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  25.61 
 
 
469 aa  82  6e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  25.17 
 
 
477 aa  81.6  6e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.76 
 
 
433 aa  81.6  7e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.31 
 
 
435 aa  81.6  7e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.97 
 
 
590 aa  80.5  1e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.35 
 
 
441 aa  80.9  1e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.29 
 
 
445 aa  80.5  2e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 
443 aa  80.5  2e-13  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  22.2 
 
 
470 aa  80.5  2e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.68 
 
 
415 aa  79.3  3e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.14 
 
 
444 aa  78.6  5e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.09 
 
 
459 aa  77.4  1e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  22.97 
 
 
407 aa  77.4  1e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.68 
 
 
403 aa  77.4  1e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.71 
 
 
407 aa  77.4  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.88 
 
 
433 aa  77.8  1e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.49 
 
 
436 aa  77  2e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  21.38 
 
 
1075 aa  77  2e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  23.7 
 
 
415 aa  76.3  3e-12  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.61 
 
 
446 aa  76.3  3e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.61 
 
 
446 aa  76.3  3e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.21 
 
 
670 aa  75.5  4e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.95 
 
 
572 aa  75.9  4e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  9.00599e-07 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  27.23 
 
 
431 aa  75.9  4e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  31.44 
 
 
442 aa  75.9  4e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.29 
 
 
419 aa  75.9  4e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.52 
 
 
432 aa  75.5  5e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  30.41 
 
 
430 aa  74.7  8e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.1 
 
 
446 aa  75.1  8e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  33.92 
 
 
567 aa  73.9  1e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  1.19274e-05 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.06 
 
 
1193 aa  74.3  1e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  27.98 
 
 
956 aa  73.9  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.99 
 
 
430 aa  74.3  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  30.99 
 
 
430 aa  74.3  1e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.13 
 
 
428 aa  73.2  2e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  28.39 
 
 
430 aa  73.6  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  28.39 
 
 
433 aa  73.6  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  28.39 
 
 
463 aa  73.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  28.39 
 
 
433 aa  73.6  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  28.39 
 
 
463 aa  73.9  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.81 
 
 
444 aa  73.9  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  28.39 
 
 
431 aa  73.2  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>