More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2081 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 153 aa  307  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  70.07 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  67.32 
 
 		 168 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 182 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  69.44 
 
 		 164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  68.75 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  49.59 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  54.84 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  45.86 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  45.53 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.55 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.17 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  38.84 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  39.2 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  43.81 
 
 		 291 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 309 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 291 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 290 aa  84  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.8 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  42.7 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  46.32 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 299 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 251 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  41.58 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.95 
 
 		 286 aa  74.7  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 311 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  40 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 293 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 293 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  43.21 
 
 		 293 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  39.53 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 277 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 318 aa  70.5  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 303 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 331 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>