130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4520 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  56.8 
 
 		 1076 aa  988    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  60.86 
 
 		 621 aa  741    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  57.01 
 
 		 815 aa  1004    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 906 aa  1886    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  27.08 
 
 		 623 aa  121  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.1 
 
 		 582 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  33.78 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 1601 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  31.51 
 
 		 665 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  23.36 
 
 		 571 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 632 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  24.71 
 
 		 833 aa  104  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  24.15 
 
 		 653 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  23.97 
 
 		 578 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.71 
 
 		 900 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  28.51 
 
 		 739 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  25.49 
 
 		 864 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  24.54 
 
 		 1100 aa  85.5  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  23.19 
 
 		 570 aa  85.1  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  24.12 
 
 		 587 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.06 
 
 		 646 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 649 aa  82  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  25.72 
 
 		 874 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  23.32 
 
 		 885 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  25.57 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.06 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.3 
 
 		 998 aa  75.5  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  28.46 
 
 		 875 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  29.18 
 
 		 851 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.18 
 
 		 978 aa  71.2  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  24.81 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 606 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  23.9 
 
 		 1105 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  28.94 
 
 		 854 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  23.23 
 
 		 2042 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.44 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  21.98 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.43 
 
 		 762 aa  61.6  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 241 aa  60.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  21.75 
 
 		 867 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 895 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  27.35 
 
 		 837 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 742 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 812 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  24.68 
 
 		 715 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  22.83 
 
 		 757 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 730 aa  55.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  21.72 
 
 		 563 aa  55.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 846 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 1224 aa  54.7  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 259 aa  54.7  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 335 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.35 
 
 		 887 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  26.19 
 
 		 613 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 291 aa  52  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 258 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 272 aa  51.2  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2434  polysaccharide deacetylase family protein  25.3 
 
 		 785 aa  51.2  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00787871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.31 
 
 		 241 aa  51.2  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.05 
 
 		 611 aa  50.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25.35 
 
 		 327 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  22.89 
 
 		 990 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  27.64 
 
 		 280 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 309 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  37.8 
 
 		 590 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 		 224 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.62 
 
 		 794 aa  48.5  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  23.74 
 
 		 880 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 213 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 295 aa  48.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  23.89 
 
 		 280 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.9 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.9 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 		 258 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  23.75 
 
 		 247 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  23.43 
 
 		 249 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 365 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.37 
 
 		 927 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.85 
 
 		 241 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  24.34 
 
 		 280 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  23.87 
 
 		 854 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 213 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  25 
 
 		 162 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  21.9 
 
 		 277 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 213 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 739 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 273 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 217 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 260 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  26.67 
 
 		 686 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>