More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3666 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  100 
 
 
566 aa  1148    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  46.8 
 
 
585 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
580 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  46.52 
 
 
575 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  46.68 
 
 
578 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.8 
 
 
520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.26 
 
 
570 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 
585 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  48.57 
 
 
585 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  47.36 
 
 
599 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.45 
 
 
520 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  47.36 
 
 
599 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.21 
 
 
603 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  47.98 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  45.93 
 
 
521 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  46.69 
 
 
566 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  46.69 
 
 
566 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  46.33 
 
 
599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  46.54 
 
 
563 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.97 
 
 
514 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  45.74 
 
 
578 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  43.36 
 
 
558 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  43.65 
 
 
567 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.39 
 
 
520 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.39 
 
 
520 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  44.19 
 
 
559 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.24 
 
 
558 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.38 
 
 
558 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  46.18 
 
 
575 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.17 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  44.08 
 
 
561 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  43.71 
 
 
550 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  45.98 
 
 
498 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.93 
 
 
871 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.15 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  52.34 
 
 
498 aa  412  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  52.15 
 
 
514 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.93 
 
 
556 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.59 
 
 
570 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.11 
 
 
568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.72 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.42 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.05 
 
 
571 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.53 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  44.98 
 
 
518 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
573 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  53.25 
 
 
502 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.38 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 
520 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.23 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40 
 
 
568 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  48.05 
 
 
515 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  53.25 
 
 
502 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  43.9 
 
 
489 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.73 
 
 
568 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.06 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.08 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.81 
 
 
566 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  51.95 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.53 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.81 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.81 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  42.61 
 
 
569 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.03 
 
 
557 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.81 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.96 
 
 
577 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  43.27 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
565 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  45.07 
 
 
500 aa  397  1e-109  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
576 aa  396  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  42.69 
 
 
606 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  53.25 
 
 
495 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.27 
 
 
552 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.33 
 
 
787 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  50 
 
 
501 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  47.82 
 
 
499 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  50.52 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
563 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  49.87 
 
 
495 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  47.59 
 
 
499 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  49.61 
 
 
522 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  43.05 
 
 
498 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  47.59 
 
 
499 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  43.74 
 
 
517 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  50 
 
 
471 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  47.59 
 
 
499 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 
610 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  47.59 
 
 
499 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.11 
 
 
568 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  48.32 
 
 
493 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  49.49 
 
 
513 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>