219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4746 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  42.96 
 
 		 1178 aa  929    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  46.78 
 
 		 1190 aa  1021    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  43.84 
 
 		 1178 aa  955    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  100 
 
 		 1171 aa  2434    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  31.67 
 
 		 975 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  47.2 
 
 		 914 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  29.48 
 
 		 1335 aa  271  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  32.14 
 
 		 1185 aa  245  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1062 aa  216  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  23.33 
 
 		 1132 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  31.51 
 
 		 925 aa  98.2  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1049 aa  90.9  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1220 aa  89.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1126 aa  87  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.54 
 
 		 1203 aa  87  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.57 
 
 		 932 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.44 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  23.93 
 
 		 1056 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.42 
 
 		 916 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.36 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.71 
 
 		 1490 aa  82.4  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 958 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.12 
 
 		 946 aa  81.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 		 1196 aa  81.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  25 
 
 		 1002 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  26.53 
 
 		 1087 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1100 aa  79  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1126 aa  78.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.16 
 
 		 1164 aa  77  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  26.54 
 
 		 1094 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  27.62 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.59 
 
 		 922 aa  74.7  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  28.48 
 
 		 1790 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.34 
 
 		 902 aa  73.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1474 aa  73.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  23.95 
 
 		 1980 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.5 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.75 
 
 		 769 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.5 
 
 		 759 aa  72  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.21 
 
 		 1099 aa  72  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.5 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.17 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.5 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.17 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  24.46 
 
 		 1622 aa  71.2  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.17 
 
 		 769 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  25.6 
 
 		 633 aa  70.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  26.6 
 
 		 1622 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.83 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  25.95 
 
 		 1157 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.21 
 
 		 1630 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1018 aa  68.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  29.37 
 
 		 758 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.79 
 
 		 934 aa  67.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.47 
 
 		 1523 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  26.24 
 
 		 553 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  26.24 
 
 		 553 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.82 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.09 
 
 		 906 aa  66.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.18 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  23.12 
 
 		 2005 aa  65.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.84 
 
 		 986 aa  65.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  22.61 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  21.52 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.62 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  26.86 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.76 
 
 		 1061 aa  65.1  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  24.65 
 
 		 1041 aa  65.1  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  23.99 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.3 
 
 		 1489 aa  65.1  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  21.52 
 
 		 633 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.29 
 
 		 1620 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.22 
 
 		 908 aa  64.3  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  25 
 
 		 2207 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.18 
 
 		 1477 aa  63.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  23.72 
 
 		 1861 aa  63.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 2759 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1724 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  24.12 
 
 		 1803 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.9 
 
 		 905 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.65 
 
 		 900 aa  62.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1823 aa  62.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.66 
 
 		 905 aa  62.4  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.99 
 
 		 905 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.99 
 
 		 905 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1116 aa  62  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  24.36 
 
 		 2204 aa  62  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1126 aa  62  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.54 
 
 		 1196 aa  60.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4598  superfamily I DNA helicase  56.86 
 
 		 95 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  26.07 
 
 		 1198 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.57 
 
 		 905 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.48 
 
 		 752 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  22.74 
 
 		 1653 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1904 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>