28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4598 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4598  superfamily I DNA helicase  100 
 
 		 95 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0653  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  78.79 
 
 		 417 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.008692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1979  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  78.79 
 
 		 417 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.312745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  56.86 
 
 		 1171 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  75.76 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  56.86 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  52.94 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  72.73 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0131896  normal  0.0593975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5513  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  72.73 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6095  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  72.73 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4903  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  72.73 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2104  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  52.83 
 
 		 413 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0282857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1983  reverse transcriptase/retron type  76.47 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.103738  normal  0.967018 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4539  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.79 
 
 		 413 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 413 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 413 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 413 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 413 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 413 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2197  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.98 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1481  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.15 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.251743  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0245  RNA-directed DNA polymerase  45.07 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0075  RNA-directed DNA polymerase  52.08 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6736  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  63.89 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0056  reverse transcriptase  65.52 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3413  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  63.89 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  66.67 
 
 		 1178 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  66.67 
 
 		 1178 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>